Aunque actualmente su uso es muy limitado se espera que los superconductores tengan un gran impacto en el transporte. Por una parte la posibilidad de construir motores superconductores mucho más pequeños y ligeros es muy interesante para la navegación marítima. La empresa americana American Superconductors ya ha construido un prototipo de barco impulsado mediante un motor superconductor. De forma similar los motores superconductores pueden utilizarse en automóviles como el construido por la empresa japonesa Sumitomo.
En el ámbito ferroviario los superconductores pueden utilizarse para construir trenes que levitan sobre vías magnéticas. Los superconductores se colocan en los bajos del tren y pueden utilizarse en la levitación de dos formas. En el tren maglev de Japón los superconductores se utilizan para generar campos magnéticos y el tren levita sobre las vías por levitación magnética aprovechando que los polos magnéticos iguales se repelen. Por el contrario en el prototipo de tren urbano que se está construyendo en Brasil se utiliza la levitación magnética superconductora. Los trenes que levitan son más seguros y pueden alcanzar altas velocidades.